Το Πρωτοδικείο Χανίων, μετά και από την εφαρμογή του Νόμου 5108/2024 “Ενοποίηση του πρώτου βαθμού δικαιοδοσίας, χωροταξική αναδιάρθρωση των δικαστηρίων της πολιτικής και ποινικής δικαιοσύνης και άλλες διατάξεις.” (ΦΕΚ Α’ 65/2-5-2024), αποτελεί το μόνο Δικαστήριο πρώτου βαθμού δικαιοδοσίας για την Περιφερειακή Ενότητα Χανίων και έχει την κύρια έδρα του στην πόλη των Χανίων και την περιφερειακή έδρα του στον Βάμο Αποκορώνου.